Basal aktivitet av SP6 promotoren

In vitro-forsøk er de utført utenfor en levende organisme i et prøverør eller lignende miljø. Forskere kan gjøre RNA kopier eller avskrift av et gen in vitro gjennom en prosess som kalles in vitro transkripsjon . Enzymet som gjør RNA transkript basert på genet kalles en RNA polymerase. Et slikt molekyl er SP6 polymerase. Det krever en strekning av DNA kalles SP6 promoter for å fungere skikkelig . Promoters

En promoter er regionen av DNA bundet av en RNA -polymerase for å innlede transkripsjon. Den SP6 polymerase krever at en meget spesifikk sekvens til stede i den promoter for å binde , slik at når SP6 polymerase anvendes for in vitro transkripsjon, må genet inneholde SP6 promoter for transkripsjon til å forekomme. Den SP6 polymerase er fra en type virus kalt en bakteriofag ; bioteknologiske selskaper produserer denne polymerase ved å infisere salmonellabakteriermed fag og deretter isolere polymerase .
Expression

Basal uttrykk eller aktivitet refererer til nivået av uttrykk i fravær av andre molekyler som vil øke eller redusere nivået av transkripsjon . Aktivatorer eller repressorer , for eksempel, er proteiner som kan binde seg til promotor og andre genregulatoriske regioner og enten hjelpe til å rekruttere RNA- polymerase , eller forhindre det fra å binde . Indusere er molekyler som øker produksjonen av genet produktet ved å heve uttrykk nivåer .
SP6

Basal aktivitet for SP6 arrangøren vil variere avhengig av forholdene i eksperimentet . Den viktigste faktor er selvfølgelig er hvordan de eksperimentelle betingelser kan påvirke aktiviteten , og hvor SP6 sammenlignet med andre systemer. Generelt, SP6 -polymerase og promotorer gir lavere effektivitet enn den T7 eller T3 in vitro transkripsjonssystem, selv under ideelle forhold SP6 er omtrent sammenlignbare med de to andre. Som SP6 , både T7 og T3 bruke en RNA polymerase fra bakteriofag .