Proteinet i dødt organisk materiale , for eksempel i døde akvatiske planter og dyr , brytes ned til ammoniakk som organisk materiale råtner . Avfall fra levende akvatiske dyr , samt avfall av landdyr som bekker i vassdrag , også inneholder ammoniakk. Ammoniakk er giftig for alle akvatiske dyr. Samtidig som proteiner og avfall brytes ned til ammoniakk , levende planter innenfor vann utgivelsen økosystem oksygen i vannet som et biprodukt av deres fotosyntese .
Bilder bakteriekolonier oksidere Ammoniakk å produsere Nitritter
Kolonier av akvatiske Nitrosomonas bakterier i vannet binder ammoniakken i vannet med oksygen frigjøres av plantene og oksygen som blandes inn i vannet fra luften gjennom bevegelse i vannflaten . Den oksyderte ammoniakk at Nitrosomonas produsere kalles nitritt , også kalt NO2 . Som ammoniakk , nitritt er også giftig for vannlevende dyr. De Nitrosomonas bakterier oksidere ammoniakken for å få energi gjennom oksidasjon , som de bruker til drivstoff deres metabolske
arkivbakteriekolonieroksidere nitritt under dannelse Nitrater
kolonier av bakterier som lever i vann nitrospira deretter binde en annen oksygen til nitritt , for å produsere nitrat , som også er kommentert som NO3 . Skjønt, som nitrater og ammoniakk, nitrat er også toksiske for akvatiske dyrelivet, det er relativt nøytralt i forhold til disse kjemikalier. Det er også i form av nitrogen som kan være direkte absorbert av planter og cyanobakterier .
Blå-grønne alger og planter forbrenne Nitrater å produsere aminosyrer
Cyanobakterier , som også er kalt blågrønnalger , er vannlevende bakterier som utfører fotosyntese. Selv om enkelte cyanobakterier er encellede organismer , de vokser i kolonier som kan bli så store at de er synlige for det blotte øye . En cyanobacterium gjør også opp anlegget cellens kloroplast , som er det som gjør det mulig for anlegget å utføre fotosyntese. Cyanobakterier og vannplanter absorbere nitrater fra vannet , og bruke dem til å danne aminosyrer . Aminosyrer utgjør proteinmolekyler og proteiner er en viktig byggekloss i livet . Den nitrat virker som et gjødsel for de vannplanter . Plantene blir da mat for akvatiske dyr , som produserer ammoniakk -rike avfall. Dødt plantemateriale igjen fra fôring også utgivelser ammoniakk til det akvatiske økosystemet , fyre opp nitrogenkretsløpet .