En ekstra hard vanskelighetsgrad innstillingen er tilgjengelig hvis du har fullført spillet på noen av standardvanskelighetsgrader. Dette kalles Hyper Mode og kan være slått på "Alternativer" -menyen av hovedmenyen .
Secret Endings
Det er to hemmelige avslutninger du kan låse opp i spillet. Fullføre spillet og oppnå minst 75 prosent av drakten oppgraderinger for å vise en utvidet slutt og fullføre spillet mens samle alle 100 av de hemmelige pickups å vise en alternativ avslutning etter kreditt sekvens .
Dobbel Jumping
Samus , din karakter, har muligheten til å plante små bomber som presser henne opp et par meter når de eksploderer. For å utføre en dobbelt hopp , hoppe, slippe en bombe , og deretter umiddelbart slippe et sekund ; den første bombe vil eksplodere , presser deg opp , og som du kommer opp den andre bombe vil eksplodere , presser du opp ytterligere.
Friend Vouchers
Friend kuponger er brukt som en type valuta i spillet , gitt for å fullføre ulike oppgaver. For å få noen enkle venn bilag, se etter en Morph Ball område (små tunneler som Samus kan navigere gjennom i Morph Ball form) og se etter små kakerlakk - lignende skapninger . Rull ballen over dem og kontinuerlig slippe bomber, squishing hundrevis og blåser opp andre, som vil gi deg mange venne bilag. Alternativt i SkyTown , vil du finne en gruppe fiendtlige steambots ; bare forvandle seg til en ball, lade opp , og ram inn i dem , kutte ut sine ben fra under dem . Dette vil gi deg flere venn bilag.