Hvordan fortelle om en aptamer har funnet sin Target

aptamers er relativt korte kjeder av nukleotider som er opprettet for å binde seg til et bestemt mål . De nukleotider er de samme komponentene som utgjør DNA -eller RNA-molekyler , og når de er satt inn i det riktige konfigurasjon at de er meget spesifikke , og har høy affinitet for deres mål. Den høye spesifisitet betyr aptamer binder bare til målet den er designet for , og høy affinitet betyr aptamer binder veldig lett til målet sitt .
Men disse er bare små molekyler , og du kan ikke bare ta en titt og se at de matchet opp med sine mål . Heldigvis finnes det måter å få den aptamer å rapportere tilbake . Det er to forskjellige generelle konfigurasjoner , en der aptamer binder sitt mål internt eller på bare én ekstern bindingssetet , og den andre hvor målet binder på to sites.Things du trenger
aptamer syntese utstyr
gull elektroder og nanopartikler arkiv Target molekyler i passende bufferløsninger
Amperemeter på
Vis flere Instruksjoner arkivEnkeltSideBinding
en

Fest en ferrocene kompleks til den ene enden av den aptamer . Ferrocene er en organometallisk forbindelse som har gode elektron - overføringsegenskaper .
To

Bygg aptamer med en tiolgruppe å avslutte den andre enden . Den tiolgruppe er en svovel - hydrogen ordning som har en sterk affinitet for gull .
3

Konstruer en gull elektrode , og lar aptamers å feste til overflaten .

4

Fordyp elektroden i løsningen av interesse, og å overvåke strømmen. Når aptamer binder sitt mål , vil det endre konfigurasjonen og bringe dens to ender nær hverandre . Dette bringer ferrocene nær gullet elektroden , noe som øker den nåværende , så overvåke den nåværende kan fortelle deg hvor mange av de aptamers har funnet sine mål .
Double Side Binding
5 fargeendringer en metode for å kontrollere aptamer binding .

Immobilize ene enden av en aptamer til en fast overflate.
6

Innføre målmolekylet i løsningen som omgir aptamers på den faste overflate.
7

Konstruer en annen aptamer spesifikke for det samme målet molekylet , og legge ved en gull nanopartikler til den andre enden .
8

Vask løsningen , deretter innføre en nanopartikkel vekst løsning . Veksten løsningen vil sette ekstra gull på nanopartikkel frø og lage en synlig fargeendring hvor målet molekylet er til stede . Du kan bare se på overflaten og se forskjellen i fargen der aptamer har funnet sitt mål.